Originar din Kings Park, Long Island, John Petrucci a început să cânte la chitară la vârsta de 12 ani. Deși în primul rând a învățat auto didactiv, el a absolvit la Berklee College of Music din Boston, în anii 1980, unde a învățat compoziția jazz și armonie. In timp ce era la Berklee John a facut cunostinta cu John Myung si Mike Portnoy, formand o trupa numita Majesty (care va fi re-numit mai târziu Dream Theater). Dream Theater a inregistrat zece albume si in prezent tocmai a finalizat un turneu mondial pentru sustinerea albumului Systematic Chaos. În 1999, John Petrucci și echipa de cercetare și design Music Man, au colaborat la o noua chitară signature model de John Petrucci. Ambele modele de 6 și 7 corzi au fost preferatele fanilor si au ajutat la atingerea succesului la nivel mondial. 2006 a marcat introducerea lui John și cea mai nouă versiune de Music Man, The JP Ball Family Rezerve. O versiune mai actualizata dispunind de un bloc de ton mahagony cu gat mahagony si un frumos top Maple. Acest nou BFR este principalul instrument de tur al lui John și este disponibil în întreaga lume. In momentul de fata John si Dream Theater sunt la finisarea pieselor de pe albumul al 11-lea, încă fara titlu care va aparea la inceputul verii 2009.